IBOShop unterstützt den Einsatz von SSL (Secure Socket Layer). Hierdurch werden alle Daten mit einem 40 Bit Schlüssel mit dem RC4-Algorithmus verschlüsselt. Die sichere Übertragung der Bestelldaten vom Web-Server zum Händler kann wahlweise mittels verschlüsseltem FTP erfolgen.
Im Schritt „Sicherheit“ kann optional die Adresse eines Secure Web-Server, der das SSL Protokoll (Secure Socket Layer) unterstützt, eingetragen werden. Einige Provider bieten diese Möglichkeit an. Sie sollten diese Möglichkeit nutzen, wenn Sie im Bestellformular vertrauliche Daten (z.B. Kreditkartennummer oder die Bankverbindung) abfragen wollen.
Sie sollten die Option ‚Bestelldaten verschlüsseln‘ wählen, um die Daten sicher auf ihrem Server abzulegen. So können Sie verhindern, dass andere Personen, die Ihre Dateien lesen können, diese auswerten können (z.B. Webmaster, Administratoren o.ä.). Oft genug haben auch andere Benutzer bei Fehlkonfiguration des Servers Lesezugriff auf Ihre Dateien.